中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所始建于1955年，是我國(guó)成立最早的一所國(guó)家級(jí)研究中藥的專門機(jī)構(gòu)。自1983年起被確認(rèn)為世界衛(wèi)生組織傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)合作中心。

    中藥研究所經(jīng)過(guò)六十余年的科學(xué)研究實(shí)踐，培養(yǎng)造就了一批從事文獻(xiàn)、中藥資源及品種鑒定、化學(xué)、質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、炮制、制劑、藥理、毒理和新藥研發(fā)等的科技骨干。全所現(xiàn)有職工400余人，設(shè)有中藥理論與本草文獻(xiàn)研究中心、生藥研究中心、中藥質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)研究中心、中藥制劑研究中心、中藥炮制研究中心、中藥藥代動(dòng)力學(xué)研究中心、中藥藥理研究中心、生物力藥理學(xué)研究中心、中藥安全評(píng)價(jià)中心（GLP）、中藥注射劑安全性研究中心、中藥新藥研發(fā)中心、中藥生物技術(shù)研究中心、中藥數(shù)據(jù)中心、整合中藥學(xué)研究中心、霧化吸入制劑研究中心和中藥質(zhì)量控制技術(shù)國(guó)家工程實(shí)驗(yàn)室。中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院下屬機(jī)構(gòu)中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院青蒿素研究中心，與中藥研究所一體化發(fā)展，由中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院任命，我所屠呦呦研究員為該中心主任。擁有4個(gè)國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科，5個(gè)國(guó)家中醫(yī)藥管理局三級(jí)中醫(yī)藥科研實(shí)驗(yàn)室，1個(gè)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。主辦國(guó)家級(jí)學(xué)術(shù)期刊《中國(guó)中藥雜志》、《中國(guó)實(shí)驗(yàn)方劑學(xué)雜志》及科普期刊《家庭中醫(yī)藥》。設(shè)有中藥學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合基礎(chǔ)碩士研究生、博士研究生培養(yǎng)點(diǎn)及中西醫(yī)結(jié)合基礎(chǔ)、中藥學(xué)博士后流動(dòng)站。